O aeroporto internacional de San Diego fica situado a menos de 10 minutos de automóvel do centro da cidade (cerca de 3 km).
Ao contrário de outros aeroportos nos Estados Unidos, para chegar ao centro da cidade não precisa de alugar automóvel.
O táxi e o serviço expresso de autocarro são as opções mais cómodas para ir do aeroporto para o centro de San Diego.
As empresas de táxi autorizadas a operar no aeroporto são a Yellow Cab, American Cab, Orange Cab e San Diego Cab. Os pontos de táxi estão localizados na saída dos terminais de chegadas. Uma corrida até ao centro custa aproximadamente 15 dólares.

San Diego
As paragens estão localizadas à saída dos terminais 1 e 2. O serviço funciona das 5h e as 23h30 com frequências de 15 minutos durante a semana e de 30 minutos aos fins-de-semana e feriados. O bilhete custa 2,25 dólares.
Diversas empresas operam serviços de shuttle entre o aeroporto e diversos locais da região de San Diego em carrinhas e autocarros executivos. A Advanced Shuttle, Airport Shuttle e Coronal Livery são algumas das empresas que prestam este tipo de serviço no aeroporto.
Para circular na cidade, a melhor opção é comprar um passe, com a duração de 24h a 4 dias, e que dá direito a viajar de forma ilimitada em toda a rede de autocarros e comboios da cidade. O passe diário custa 5 dólares.
No site da San Diego MTS (Metropolitan Transit System) encontra uma ferramenta, designada por Trip Planner, que permite escolher as melhores opções para se deslocar entre vários pontos na cidade.